En biogasanläggning har en positiv inverkan på miljön på flera sätt. Produkterna som lämnar biogasanläggningen, gas och biogödsel, har en direkt påverkan på miljön, och det faktum att biogasanläggningen använder olika typer av organiska restprodukter ger dessutom indirekt en positiv påverkan på miljön.Reducering av växthusgaser
När biogasens metan förbränns ger detta ingen nettotillförsel av koldioxid till atmosfären eftersom kolet härstammar från luftens koldioxid som bundits in av växterna. Det ger dessutom lägre halter av kväveföreningar och flyktiga kolväten och bildar inte stoft och aska. Hur stora miljövinsterna blir beror på vilket energisystem som byts ut. När gasen bytes ut mot till exempel olja minskar behovet av ändliga resurser och koldioxidutsläppen minskar. Biogasproduktion från gödsel kan medföra stora minskningar av växthusgaser tack vare att metan och lustgas förlusterna i förbindelse med hantering och lagring av gödsel kan reduceras.
Minskade förluster av kväve till vatten och luft
I rötningsprocessen mineraliseras kvävet och andelen lättillgängligt kväve ökar. Detta innebär att man får ett effektivare kvävegödselmedel vilket tillåter bättre precisionsgödsling, och därmed förbättrat kväveutnyttjande och minskad risk för förluster av kväve via ammoniakavgång och nitratläckage. Luktminskning av stallgödsel
Rötningsprocessen reducerar gödselns innehåll av illaluktande komponenter och luktar därför mindre vid spridning. Rötning i 35° C i 20 dagar, som är vanligt vid rötning av gödsel, ger reducering av en rad patogener och andel grobara ogräsfrön minskar. För att få en säker hygienisering av gödseln krävs dock en termofil process (55° C).
